Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Med16Q6PGF3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms