Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFQ7

Rasa4, Ras GTPase-activating protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa4Q6PFQ7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rasa4Q6PFQ7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rasa4Q6PFQ7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rasa4Q6PFQ7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rasa4Q6PFQ7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rasa4Q6PFQ7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rasa4Q6PFQ7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rasa4Q6PFQ7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rasa4Q6PFQ7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rasa4Q6PFQ7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rasa4Q6PFQ7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rasa4Q6PFQ7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rasa4Q6PFQ7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rasa4Q6PFQ7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rasa4Q6PFQ7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rasa4Q6PFQ7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rasa4Q6PFQ7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rasa4Q6PFQ7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rasa4Q6PFQ7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rasa4Q6PFQ7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rasa4Q6PFQ7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rasa4Q6PFQ7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rasa4Q6PFQ7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms