Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Trak1Q6PD31 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Trak1Q6PD31 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Trak1Q6PD31 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Trak1Q6PD31 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Trak1Q6PD31 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Trak1Q6PD31 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Trak1Q6PD31 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Trak1Q6PD31 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Trak1Q6PD31 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Trak1Q6PD31 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Trak1Q6PD31 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Trak1Q6PD31 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Trak1Q6PD31 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Trak1Q6PD31 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Trak1Q6PD31 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Trak1Q6PD31 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Trak1Q6PD31 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Trak1Q6PD31 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Trak1Q6PD31 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Trak1Q6PD31 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Trak1Q6PD31 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Trak1Q6PD31 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Trak1Q6PD31 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Trak1Q6PD31 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Trak1Q6PD31 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Trak1Q6PD31 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Trak1Q6PD31 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Trak1Q6PD31 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Trak1Q6PD31 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Trak1Q6PD31 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Trak1Q6PD31 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Trak1Q6PD31 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Trak1Q6PD31 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Trak1Q6PD31 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Trak1Q6PD31 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Trak1Q6PD31 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Trak1Q6PD31 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Trak1Q6PD31 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Trak1Q6PD31 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Trak1Q6PD31 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Trak1Q6PD31 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Trak1Q6PD31 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Trak1Q6PD31 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Trak1Q6PD31 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
Trak1Q6PD31 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Trak1Q6PD31 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Trak1Q6PD31 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Trak1Q6PD31 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Trak1Q6PD31 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Trak1Q6PD31 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Trak1Q6PD31 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Trak1Q6PD31 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Trak1Q6PD31 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Trak1Q6PD31 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Trak1Q6PD31 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Trak1Q6PD31 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Trak1Q6PD31 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Trak1Q6PD31 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Trak1Q6PD31 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Trak1Q6PD31 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Trak1Q6PD31 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Trak1Q6PD31 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Trak1Q6PD31 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Trak1Q6PD31 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Trak1Q6PD31 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Trak1Q6PD31 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Trak1Q6PD31 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Trak1Q6PD31 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Trak1Q6PD31 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Trak1Q6PD31 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Trak1Q6PD31 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Trak1Q6PD31 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Trak1Q6PD31 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Trak1Q6PD31 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Trak1Q6PD31 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Trak1Q6PD31 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Trak1Q6PD31 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Trak1Q6PD31 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Trak1Q6PD31 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Trak1Q6PD31 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Trak1Q6PD31 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Trak1Q6PD31 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Trak1Q6PD31 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Trak1Q6PD31 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Trak1Q6PD31 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Trak1Q6PD31 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Trak1Q6PD31 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Trak1Q6PD31 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Trak1Q6PD31 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Trak1Q6PD31 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Trak1Q6PD31 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Trak1Q6PD31 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Trak1Q6PD31 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Trak1Q6PD31 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Trak1Q6PD31 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Trak1Q6PD31 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Trak1Q6PD31 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Trak1Q6PD31 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Trak1Q6PD31 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms