Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slf2Q6P9P0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slf2Q6P9P0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slf2Q6P9P0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slf2Q6P9P0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slf2Q6P9P0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slf2Q6P9P0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slf2Q6P9P0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Slf2Q6P9P0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slf2Q6P9P0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slf2Q6P9P0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slf2Q6P9P0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slf2Q6P9P0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slf2Q6P9P0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slf2Q6P9P0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slf2Q6P9P0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slf2Q6P9P0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slf2Q6P9P0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slf2Q6P9P0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slf2Q6P9P0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slf2Q6P9P0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slf2Q6P9P0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slf2Q6P9P0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slf2Q6P9P0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slf2Q6P9P0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slf2Q6P9P0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slf2Q6P9P0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Slf2Q6P9P0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Slf2Q6P9P0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Slf2Q6P9P0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slf2Q6P9P0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slf2Q6P9P0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slf2Q6P9P0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slf2Q6P9P0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slf2Q6P9P0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slf2Q6P9P0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slf2Q6P9P0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slf2Q6P9P0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slf2Q6P9P0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slf2Q6P9P0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slf2Q6P9P0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slf2Q6P9P0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slf2Q6P9P0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slf2Q6P9P0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slf2Q6P9P0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slf2Q6P9P0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slf2Q6P9P0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slf2Q6P9P0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slf2Q6P9P0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms