Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T1

Snx19, Sorting nexin-19, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx19Q6P4T1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx19Q6P4T1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx19Q6P4T1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx19Q6P4T1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx19Q6P4T1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx19Q6P4T1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx19Q6P4T1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx19Q6P4T1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx19Q6P4T1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx19Q6P4T1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx19Q6P4T1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx19Q6P4T1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx19Q6P4T1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx19Q6P4T1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx19Q6P4T1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx19Q6P4T1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx19Q6P4T1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx19Q6P4T1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx19Q6P4T1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx19Q6P4T1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx19Q6P4T1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx19Q6P4T1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx19Q6P4T1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx19Q6P4T1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx19Q6P4T1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx19Q6P4T1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx19Q6P4T1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx19Q6P4T1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx19Q6P4T1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx19Q6P4T1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx19Q6P4T1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx19Q6P4T1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx19Q6P4T1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx19Q6P4T1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx19Q6P4T1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snx19Q6P4T1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snx19Q6P4T1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snx19Q6P4T1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx19Q6P4T1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx19Q6P4T1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx19Q6P4T1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx19Q6P4T1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx19Q6P4T1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx19Q6P4T1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx19Q6P4T1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx19Q6P4T1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx19Q6P4T1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx19Q6P4T1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx19Q6P4T1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx19Q6P4T1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx19Q6P4T1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx19Q6P4T1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx19Q6P4T1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx19Q6P4T1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx19Q6P4T1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx19Q6P4T1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx19Q6P4T1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx19Q6P4T1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx19Q6P4T1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx19Q6P4T1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx19Q6P4T1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx19Q6P4T1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx19Q6P4T1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx19Q6P4T1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx19Q6P4T1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx19Q6P4T1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx19Q6P4T1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx19Q6P4T1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx19Q6P4T1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx19Q6P4T1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx19Q6P4T1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx19Q6P4T1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx19Q6P4T1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx19Q6P4T1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx19Q6P4T1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx19Q6P4T1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx19Q6P4T1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms