Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpbp1Q6NXH3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpbp1Q6NXH3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpbp1Q6NXH3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpbp1Q6NXH3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpbp1Q6NXH3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gpbp1Q6NXH3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gpbp1Q6NXH3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gpbp1Q6NXH3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gpbp1Q6NXH3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gpbp1Q6NXH3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gpbp1Q6NXH3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gpbp1Q6NXH3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gpbp1Q6NXH3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gpbp1Q6NXH3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gpbp1Q6NXH3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gpbp1Q6NXH3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gpbp1Q6NXH3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gpbp1Q6NXH3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gpbp1Q6NXH3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gpbp1Q6NXH3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gpbp1Q6NXH3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gpbp1Q6NXH3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gpbp1Q6NXH3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gpbp1Q6NXH3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gpbp1Q6NXH3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gpbp1Q6NXH3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gpbp1Q6NXH3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gpbp1Q6NXH3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gpbp1Q6NXH3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gpbp1Q6NXH3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gpbp1Q6NXH3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gpbp1Q6NXH3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gpbp1Q6NXH3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gpbp1Q6NXH3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gpbp1Q6NXH3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gpbp1Q6NXH3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gpbp1Q6NXH3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gpbp1Q6NXH3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gpbp1Q6NXH3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gpbp1Q6NXH3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gpbp1Q6NXH3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gpbp1Q6NXH3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpbp1Q6NXH3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpbp1Q6NXH3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpbp1Q6NXH3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpbp1Q6NXH3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpbp1Q6NXH3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpbp1Q6NXH3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpbp1Q6NXH3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpbp1Q6NXH3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpbp1Q6NXH3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpbp1Q6NXH3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpbp1Q6NXH3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpbp1Q6NXH3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpbp1Q6NXH3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpbp1Q6NXH3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpbp1Q6NXH3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gpbp1Q6NXH3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gpbp1Q6NXH3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gpbp1Q6NXH3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gpbp1Q6NXH3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gpbp1Q6NXH3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gpbp1Q6NXH3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gpbp1Q6NXH3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpbp1Q6NXH3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpbp1Q6NXH3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpbp1Q6NXH3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gpbp1Q6NXH3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gpbp1Q6NXH3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms