Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fndc3bQ6NWW9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fndc3bQ6NWW9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fndc3bQ6NWW9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fndc3bQ6NWW9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fndc3bQ6NWW9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fndc3bQ6NWW9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fndc3bQ6NWW9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fndc3bQ6NWW9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fndc3bQ6NWW9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fndc3bQ6NWW9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fndc3bQ6NWW9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fndc3bQ6NWW9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Fndc3bQ6NWW9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fndc3bQ6NWW9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fndc3bQ6NWW9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fndc3bQ6NWW9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fndc3bQ6NWW9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fndc3bQ6NWW9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fndc3bQ6NWW9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fndc3bQ6NWW9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fndc3bQ6NWW9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Fndc3bQ6NWW9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fndc3bQ6NWW9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fndc3bQ6NWW9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fndc3bQ6NWW9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fndc3bQ6NWW9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fndc3bQ6NWW9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fndc3bQ6NWW9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fndc3bQ6NWW9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fndc3bQ6NWW9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fndc3bQ6NWW9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fndc3bQ6NWW9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fndc3bQ6NWW9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Fndc3bQ6NWW9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fndc3bQ6NWW9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fndc3bQ6NWW9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fndc3bQ6NWW9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fndc3bQ6NWW9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fndc3bQ6NWW9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fndc3bQ6NWW9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fndc3bQ6NWW9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fndc3bQ6NWW9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fndc3bQ6NWW9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fndc3bQ6NWW9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fndc3bQ6NWW9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fndc3bQ6NWW9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fndc3bQ6NWW9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fndc3bQ6NWW9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fndc3bQ6NWW9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fndc3bQ6NWW9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fndc3bQ6NWW9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fndc3bQ6NWW9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fndc3bQ6NWW9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fndc3bQ6NWW9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fndc3bQ6NWW9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fndc3bQ6NWW9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fndc3bQ6NWW9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fndc3bQ6NWW9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Fndc3bQ6NWW9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fndc3bQ6NWW9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fndc3bQ6NWW9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fndc3bQ6NWW9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Fndc3bQ6NWW9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fndc3bQ6NWW9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fndc3bQ6NWW9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fndc3bQ6NWW9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fndc3bQ6NWW9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fndc3bQ6NWW9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fndc3bQ6NWW9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fndc3bQ6NWW9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fndc3bQ6NWW9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fndc3bQ6NWW9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Fndc3bQ6NWW9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fndc3bQ6NWW9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fndc3bQ6NWW9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fndc3bQ6NWW9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc3bQ6NWW9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc3bQ6NWW9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc3bQ6NWW9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc3bQ6NWW9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc3bQ6NWW9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc3bQ6NWW9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc3bQ6NWW9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc3bQ6NWW9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc3bQ6NWW9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc3bQ6NWW9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Fndc3bQ6NWW9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fndc3bQ6NWW9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fndc3bQ6NWW9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Fndc3bQ6NWW9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fndc3bQ6NWW9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fndc3bQ6NWW9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fndc3bQ6NWW9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fndc3bQ6NWW9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fndc3bQ6NWW9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Fndc3bQ6NWW9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fndc3bQ6NWW9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fndc3bQ6NWW9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms