Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Wdr44Q6NVE8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Wdr44Q6NVE8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Wdr44Q6NVE8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Wdr44Q6NVE8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Wdr44Q6NVE8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Wdr44Q6NVE8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Wdr44Q6NVE8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Wdr44Q6NVE8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Wdr44Q6NVE8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Wdr44Q6NVE8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Wdr44Q6NVE8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Wdr44Q6NVE8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Wdr44Q6NVE8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Wdr44Q6NVE8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Wdr44Q6NVE8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Wdr44Q6NVE8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Wdr44Q6NVE8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Wdr44Q6NVE8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Wdr44Q6NVE8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Wdr44Q6NVE8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Wdr44Q6NVE8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Wdr44Q6NVE8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Wdr44Q6NVE8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Wdr44Q6NVE8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Wdr44Q6NVE8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Wdr44Q6NVE8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Wdr44Q6NVE8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Wdr44Q6NVE8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Wdr44Q6NVE8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wdr44Q6NVE8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wdr44Q6NVE8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wdr44Q6NVE8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wdr44Q6NVE8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wdr44Q6NVE8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wdr44Q6NVE8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wdr44Q6NVE8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wdr44Q6NVE8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wdr44Q6NVE8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wdr44Q6NVE8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wdr44Q6NVE8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wdr44Q6NVE8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Wdr44Q6NVE8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Wdr44Q6NVE8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wdr44Q6NVE8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wdr44Q6NVE8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wdr44Q6NVE8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Wdr44Q6NVE8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Wdr44Q6NVE8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Wdr44Q6NVE8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Wdr44Q6NVE8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Wdr44Q6NVE8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Wdr44Q6NVE8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wdr44Q6NVE8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wdr44Q6NVE8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms