Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc8eQ66JT1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc8eQ66JT1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc8eQ66JT1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrc8eQ66JT1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrc8eQ66JT1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrc8eQ66JT1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrc8eQ66JT1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrc8eQ66JT1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrc8eQ66JT1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lrrc8eQ66JT1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lrrc8eQ66JT1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lrrc8eQ66JT1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lrrc8eQ66JT1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lrrc8eQ66JT1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lrrc8eQ66JT1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lrrc8eQ66JT1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lrrc8eQ66JT1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Lrrc8eQ66JT1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 189.9 ms