Protein–RNA interactions for Protein: Q64512

Ptpn13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn13Q64512 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptpn13Q64512 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptpn13Q64512 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptpn13Q64512 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptpn13Q64512 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptpn13Q64512 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptpn13Q64512 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptpn13Q64512 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptpn13Q64512 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptpn13Q64512 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptpn13Q64512 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptpn13Q64512 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptpn13Q64512 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ptpn13Q64512 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptpn13Q64512 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptpn13Q64512 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptpn13Q64512 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptpn13Q64512 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptpn13Q64512 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptpn13Q64512 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptpn13Q64512 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptpn13Q64512 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptpn13Q64512 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptpn13Q64512 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn13Q64512 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn13Q64512 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn13Q64512 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn13Q64512 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn13Q64512 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn13Q64512 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn13Q64512 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptpn13Q64512 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptpn13Q64512 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptpn13Q64512 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptpn13Q64512 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptpn13Q64512 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptpn13Q64512 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptpn13Q64512 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn13Q64512 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn13Q64512 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn13Q64512 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn13Q64512 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn13Q64512 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn13Q64512 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn13Q64512 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn13Q64512 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn13Q64512 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn13Q64512 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn13Q64512 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn13Q64512 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms