Protein–RNA interactions for Protein: Q63934

Pou4f2, POU domain, class 4, transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f2Q63934 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pou4f2Q63934 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou4f2Q63934 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Pou4f2Q63934 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou4f2Q63934 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou4f2Q63934 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou4f2Q63934 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou4f2Q63934 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou4f2Q63934 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou4f2Q63934 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou4f2Q63934 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms