Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Foxd1Q61345 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Foxd1Q61345 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Foxd1Q61345 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Foxd1Q61345 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Foxd1Q61345 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Foxd1Q61345 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Foxd1Q61345 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Foxd1Q61345 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Foxd1Q61345 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Foxd1Q61345 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Foxd1Q61345 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Foxd1Q61345 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Foxd1Q61345 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Foxd1Q61345 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Foxd1Q61345 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Foxd1Q61345 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Foxd1Q61345 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Foxd1Q61345 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Foxd1Q61345 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Foxd1Q61345 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Foxd1Q61345 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Foxd1Q61345 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Foxd1Q61345 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Foxd1Q61345 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Foxd1Q61345 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Foxd1Q61345 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Foxd1Q61345 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Foxd1Q61345 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Foxd1Q61345 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Foxd1Q61345 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Foxd1Q61345 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Foxd1Q61345 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Foxd1Q61345 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Foxd1Q61345 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Foxd1Q61345 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Foxd1Q61345 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Foxd1Q61345 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Foxd1Q61345 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Foxd1Q61345 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Foxd1Q61345 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Foxd1Q61345 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Foxd1Q61345 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Foxd1Q61345 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Foxd1Q61345 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Foxd1Q61345 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Foxd1Q61345 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Foxd1Q61345 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Foxd1Q61345 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Foxd1Q61345 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Foxd1Q61345 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Foxd1Q61345 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Foxd1Q61345 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Foxd1Q61345 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Foxd1Q61345 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Foxd1Q61345 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Foxd1Q61345 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Foxd1Q61345 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Foxd1Q61345 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Foxd1Q61345 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Foxd1Q61345 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Foxd1Q61345 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Foxd1Q61345 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Foxd1Q61345 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Foxd1Q61345 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Foxd1Q61345 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Foxd1Q61345 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Foxd1Q61345 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Foxd1Q61345 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Foxd1Q61345 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Foxd1Q61345 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Foxd1Q61345 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Foxd1Q61345 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Foxd1Q61345 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Foxd1Q61345 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Foxd1Q61345 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Foxd1Q61345 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Foxd1Q61345 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Foxd1Q61345 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Foxd1Q61345 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Foxd1Q61345 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Foxd1Q61345 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Foxd1Q61345 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Foxd1Q61345 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Foxd1Q61345 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Foxd1Q61345 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Foxd1Q61345 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Foxd1Q61345 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Foxd1Q61345 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Foxd1Q61345 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Foxd1Q61345 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Foxd1Q61345 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Foxd1Q61345 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Foxd1Q61345 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Foxd1Q61345 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Foxd1Q61345 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Foxd1Q61345 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Foxd1Q61345 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Foxd1Q61345 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Foxd1Q61345 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms