Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NinQ61043 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NinQ61043 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NinQ61043 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NinQ61043 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NinQ61043 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NinQ61043 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NinQ61043 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NinQ61043 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NinQ61043 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NinQ61043 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NinQ61043 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NinQ61043 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NinQ61043 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NinQ61043 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NinQ61043 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NinQ61043 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NinQ61043 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NinQ61043 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NinQ61043 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NinQ61043 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NinQ61043 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NinQ61043 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NinQ61043 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NinQ61043 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NinQ61043 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NinQ61043 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NinQ61043 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NinQ61043 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NinQ61043 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NinQ61043 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NinQ61043 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NinQ61043 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NinQ61043 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NinQ61043 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NinQ61043 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NinQ61043 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NinQ61043 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NinQ61043 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NinQ61043 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NinQ61043 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NinQ61043 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NinQ61043 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NinQ61043 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NinQ61043 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NinQ61043 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NinQ61043 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NinQ61043 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NinQ61043 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NinQ61043 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NinQ61043 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NinQ61043 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NinQ61043 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NinQ61043 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NinQ61043 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NinQ61043 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NinQ61043 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NinQ61043 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NinQ61043 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NinQ61043 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NinQ61043 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NinQ61043 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NinQ61043 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NinQ61043 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NinQ61043 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NinQ61043 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NinQ61043 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NinQ61043 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NinQ61043 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NinQ61043 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NinQ61043 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NinQ61043 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NinQ61043 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NinQ61043 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NinQ61043 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NinQ61043 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NinQ61043 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NinQ61043 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NinQ61043 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NinQ61043 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NinQ61043 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NinQ61043 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NinQ61043 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NinQ61043 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NinQ61043 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NinQ61043 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NinQ61043 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NinQ61043 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NinQ61043 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NinQ61043 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NinQ61043 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NinQ61043 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NinQ61043 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NinQ61043 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NinQ61043 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NinQ61043 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NinQ61043 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NinQ61043 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NinQ61043 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NinQ61043 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms