Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc125Q5U465 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc125Q5U465 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms