Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc88aQ5SNZ0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc88aQ5SNZ0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc88aQ5SNZ0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc88aQ5SNZ0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc88aQ5SNZ0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc88aQ5SNZ0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc88aQ5SNZ0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc88aQ5SNZ0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc88aQ5SNZ0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc88aQ5SNZ0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc88aQ5SNZ0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc88aQ5SNZ0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc88aQ5SNZ0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms