Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Prkaa1Q5EG47 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Prkaa1Q5EG47 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkaa1Q5EG47 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkaa1Q5EG47 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkaa1Q5EG47 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkaa1Q5EG47 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkaa1Q5EG47 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkaa1Q5EG47 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkaa1Q5EG47 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkaa1Q5EG47 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkaa1Q5EG47 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prkaa1Q5EG47 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prkaa1Q5EG47 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prkaa1Q5EG47 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prkaa1Q5EG47 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prkaa1Q5EG47 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prkaa1Q5EG47 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prkaa1Q5EG47 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prkaa1Q5EG47 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Prkaa1Q5EG47 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prkaa1Q5EG47 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prkaa1Q5EG47 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prkaa1Q5EG47 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prkaa1Q5EG47 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prkaa1Q5EG47 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prkaa1Q5EG47 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prkaa1Q5EG47 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prkaa1Q5EG47 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prkaa1Q5EG47 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prkaa1Q5EG47 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prkaa1Q5EG47 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prkaa1Q5EG47 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prkaa1Q5EG47 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prkaa1Q5EG47 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prkaa1Q5EG47 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prkaa1Q5EG47 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prkaa1Q5EG47 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prkaa1Q5EG47 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prkaa1Q5EG47 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prkaa1Q5EG47 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prkaa1Q5EG47 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prkaa1Q5EG47 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prkaa1Q5EG47 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prkaa1Q5EG47 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prkaa1Q5EG47 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prkaa1Q5EG47 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prkaa1Q5EG47 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prkaa1Q5EG47 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prkaa1Q5EG47 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prkaa1Q5EG47 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prkaa1Q5EG47 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prkaa1Q5EG47 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prkaa1Q5EG47 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prkaa1Q5EG47 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prkaa1Q5EG47 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prkaa1Q5EG47 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prkaa1Q5EG47 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prkaa1Q5EG47 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prkaa1Q5EG47 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Prkaa1Q5EG47 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prkaa1Q5EG47 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Prkaa1Q5EG47 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prkaa1Q5EG47 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prkaa1Q5EG47 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prkaa1Q5EG47 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prkaa1Q5EG47 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prkaa1Q5EG47 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prkaa1Q5EG47 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prkaa1Q5EG47 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prkaa1Q5EG47 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prkaa1Q5EG47 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prkaa1Q5EG47 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prkaa1Q5EG47 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prkaa1Q5EG47 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prkaa1Q5EG47 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prkaa1Q5EG47 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prkaa1Q5EG47 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prkaa1Q5EG47 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prkaa1Q5EG47 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prkaa1Q5EG47 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prkaa1Q5EG47 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Prkaa1Q5EG47 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prkaa1Q5EG47 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Prkaa1Q5EG47 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms