Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syne3Q4FZC9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms