Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam228bQ497Q6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam228bQ497Q6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam228bQ497Q6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam228bQ497Q6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam228bQ497Q6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam228bQ497Q6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam228bQ497Q6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam228bQ497Q6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam228bQ497Q6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam228bQ497Q6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam228bQ497Q6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam228bQ497Q6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam228bQ497Q6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam228bQ497Q6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam228bQ497Q6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam228bQ497Q6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam228bQ497Q6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam228bQ497Q6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam228bQ497Q6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Fam228bQ497Q6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam228bQ497Q6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam228bQ497Q6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam228bQ497Q6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam228bQ497Q6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam228bQ497Q6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam228bQ497Q6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam228bQ497Q6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam228bQ497Q6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam228bQ497Q6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam228bQ497Q6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam228bQ497Q6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam228bQ497Q6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam228bQ497Q6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam228bQ497Q6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam228bQ497Q6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam228bQ497Q6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam228bQ497Q6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam228bQ497Q6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam228bQ497Q6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam228bQ497Q6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam228bQ497Q6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam228bQ497Q6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam228bQ497Q6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam228bQ497Q6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam228bQ497Q6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam228bQ497Q6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam228bQ497Q6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam228bQ497Q6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam228bQ497Q6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam228bQ497Q6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam228bQ497Q6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam228bQ497Q6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam228bQ497Q6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam228bQ497Q6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam228bQ497Q6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam228bQ497Q6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam228bQ497Q6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam228bQ497Q6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam228bQ497Q6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam228bQ497Q6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam228bQ497Q6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam228bQ497Q6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam228bQ497Q6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam228bQ497Q6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam228bQ497Q6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam228bQ497Q6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam228bQ497Q6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam228bQ497Q6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam228bQ497Q6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam228bQ497Q6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam228bQ497Q6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam228bQ497Q6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam228bQ497Q6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam228bQ497Q6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam228bQ497Q6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam228bQ497Q6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam228bQ497Q6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam228bQ497Q6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam228bQ497Q6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam228bQ497Q6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam228bQ497Q6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam228bQ497Q6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam228bQ497Q6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam228bQ497Q6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam228bQ497Q6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam228bQ497Q6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam228bQ497Q6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam228bQ497Q6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam228bQ497Q6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam228bQ497Q6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam228bQ497Q6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Fam228bQ497Q6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fam228bQ497Q6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fam228bQ497Q6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fam228bQ497Q6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fam228bQ497Q6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam228bQ497Q6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam228bQ497Q6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam228bQ497Q6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 243 ms