Protein–RNA interactions for Protein: Q497K7

Tmem247, Transmembrane protein 247, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem247Q497K7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem247Q497K7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem247Q497K7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem247Q497K7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem247Q497K7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem247Q497K7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem247Q497K7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem247Q497K7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem247Q497K7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem247Q497K7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem247Q497K7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem247Q497K7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem247Q497K7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem247Q497K7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem247Q497K7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem247Q497K7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem247Q497K7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem247Q497K7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem247Q497K7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem247Q497K7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem247Q497K7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem247Q497K7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem247Q497K7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem247Q497K7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem247Q497K7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem247Q497K7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem247Q497K7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem247Q497K7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem247Q497K7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem247Q497K7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem247Q497K7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem247Q497K7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem247Q497K7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem247Q497K7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem247Q497K7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem247Q497K7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem247Q497K7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem247Q497K7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem247Q497K7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem247Q497K7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmem247Q497K7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmem247Q497K7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmem247Q497K7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms