Protein–RNA interactions for Protein: Q3V384

Afg1l, AFG1-like ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg1lQ3V384 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Afg1lQ3V384 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Afg1lQ3V384 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Afg1lQ3V384 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Afg1lQ3V384 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Afg1lQ3V384 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Afg1lQ3V384 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Afg1lQ3V384 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Afg1lQ3V384 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Afg1lQ3V384 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Afg1lQ3V384 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Afg1lQ3V384 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Afg1lQ3V384 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Afg1lQ3V384 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Afg1lQ3V384 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Afg1lQ3V384 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Afg1lQ3V384 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Afg1lQ3V384 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Afg1lQ3V384 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Afg1lQ3V384 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Afg1lQ3V384 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Afg1lQ3V384 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Afg1lQ3V384 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Afg1lQ3V384 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Afg1lQ3V384 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Afg1lQ3V384 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Afg1lQ3V384 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Afg1lQ3V384 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Afg1lQ3V384 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Afg1lQ3V384 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Afg1lQ3V384 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Afg1lQ3V384 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Afg1lQ3V384 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Afg1lQ3V384 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Afg1lQ3V384 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Afg1lQ3V384 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Afg1lQ3V384 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Afg1lQ3V384 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Afg1lQ3V384 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Afg1lQ3V384 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Afg1lQ3V384 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Afg1lQ3V384 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Afg1lQ3V384 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Afg1lQ3V384 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Afg1lQ3V384 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Afg1lQ3V384 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Afg1lQ3V384 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Afg1lQ3V384 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Afg1lQ3V384 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Afg1lQ3V384 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Afg1lQ3V384 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Afg1lQ3V384 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Afg1lQ3V384 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Afg1lQ3V384 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Afg1lQ3V384 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Afg1lQ3V384 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Afg1lQ3V384 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Afg1lQ3V384 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Afg1lQ3V384 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Afg1lQ3V384 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Afg1lQ3V384 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Afg1lQ3V384 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Afg1lQ3V384 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Afg1lQ3V384 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Afg1lQ3V384 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Afg1lQ3V384 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Afg1lQ3V384 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Afg1lQ3V384 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Afg1lQ3V384 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Afg1lQ3V384 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Afg1lQ3V384 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Afg1lQ3V384 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Afg1lQ3V384 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Afg1lQ3V384 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Afg1lQ3V384 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Afg1lQ3V384 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Afg1lQ3V384 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Afg1lQ3V384 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Afg1lQ3V384 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Afg1lQ3V384 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Afg1lQ3V384 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Afg1lQ3V384 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Afg1lQ3V384 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Afg1lQ3V384 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Afg1lQ3V384 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Afg1lQ3V384 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Afg1lQ3V384 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Afg1lQ3V384 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Afg1lQ3V384 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Afg1lQ3V384 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Afg1lQ3V384 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Afg1lQ3V384 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Afg1lQ3V384 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Afg1lQ3V384 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Afg1lQ3V384 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Afg1lQ3V384 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Afg1lQ3V384 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Afg1lQ3V384 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Afg1lQ3V384 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Afg1lQ3V384 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms