Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZA1

Rcsd1, CapZ-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcsd1Q3UZA1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rcsd1Q3UZA1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rcsd1Q3UZA1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rcsd1Q3UZA1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rcsd1Q3UZA1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rcsd1Q3UZA1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rcsd1Q3UZA1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rcsd1Q3UZA1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rcsd1Q3UZA1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rcsd1Q3UZA1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rcsd1Q3UZA1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rcsd1Q3UZA1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rcsd1Q3UZA1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rcsd1Q3UZA1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rcsd1Q3UZA1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rcsd1Q3UZA1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rcsd1Q3UZA1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rcsd1Q3UZA1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rcsd1Q3UZA1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rcsd1Q3UZA1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rcsd1Q3UZA1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rcsd1Q3UZA1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rcsd1Q3UZA1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rcsd1Q3UZA1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rcsd1Q3UZA1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rcsd1Q3UZA1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rcsd1Q3UZA1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rcsd1Q3UZA1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rcsd1Q3UZA1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rcsd1Q3UZA1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcsd1Q3UZA1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcsd1Q3UZA1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcsd1Q3UZA1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcsd1Q3UZA1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcsd1Q3UZA1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcsd1Q3UZA1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcsd1Q3UZA1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rcsd1Q3UZA1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rcsd1Q3UZA1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rcsd1Q3UZA1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rcsd1Q3UZA1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rcsd1Q3UZA1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rcsd1Q3UZA1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rcsd1Q3UZA1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rcsd1Q3UZA1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rcsd1Q3UZA1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 555 ms