Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rnpc3Q3UZ01 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rnpc3Q3UZ01 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnpc3Q3UZ01 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnpc3Q3UZ01 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnpc3Q3UZ01 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnpc3Q3UZ01 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnpc3Q3UZ01 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnpc3Q3UZ01 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnpc3Q3UZ01 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnpc3Q3UZ01 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnpc3Q3UZ01 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnpc3Q3UZ01 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnpc3Q3UZ01 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnpc3Q3UZ01 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnpc3Q3UZ01 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnpc3Q3UZ01 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnpc3Q3UZ01 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnpc3Q3UZ01 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnpc3Q3UZ01 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnpc3Q3UZ01 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnpc3Q3UZ01 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnpc3Q3UZ01 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnpc3Q3UZ01 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnpc3Q3UZ01 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnpc3Q3UZ01 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnpc3Q3UZ01 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnpc3Q3UZ01 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnpc3Q3UZ01 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnpc3Q3UZ01 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnpc3Q3UZ01 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnpc3Q3UZ01 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnpc3Q3UZ01 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnpc3Q3UZ01 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnpc3Q3UZ01 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnpc3Q3UZ01 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnpc3Q3UZ01 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnpc3Q3UZ01 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnpc3Q3UZ01 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnpc3Q3UZ01 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnpc3Q3UZ01 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnpc3Q3UZ01 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnpc3Q3UZ01 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnpc3Q3UZ01 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnpc3Q3UZ01 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnpc3Q3UZ01 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnpc3Q3UZ01 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnpc3Q3UZ01 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnpc3Q3UZ01 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnpc3Q3UZ01 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnpc3Q3UZ01 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnpc3Q3UZ01 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnpc3Q3UZ01 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnpc3Q3UZ01 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnpc3Q3UZ01 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnpc3Q3UZ01 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnpc3Q3UZ01 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnpc3Q3UZ01 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnpc3Q3UZ01 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnpc3Q3UZ01 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnpc3Q3UZ01 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnpc3Q3UZ01 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnpc3Q3UZ01 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnpc3Q3UZ01 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnpc3Q3UZ01 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnpc3Q3UZ01 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnpc3Q3UZ01 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnpc3Q3UZ01 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnpc3Q3UZ01 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnpc3Q3UZ01 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms