Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnga4Q3UW12 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cnga4Q3UW12 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cnga4Q3UW12 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cnga4Q3UW12 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cnga4Q3UW12 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnga4Q3UW12 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnga4Q3UW12 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnga4Q3UW12 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnga4Q3UW12 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnga4Q3UW12 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnga4Q3UW12 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnga4Q3UW12 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.6 ms