Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Skap1Q3UUV5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Skap1Q3UUV5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Skap1Q3UUV5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Skap1Q3UUV5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Skap1Q3UUV5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Skap1Q3UUV5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Skap1Q3UUV5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Skap1Q3UUV5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Skap1Q3UUV5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Skap1Q3UUV5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Skap1Q3UUV5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Skap1Q3UUV5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Skap1Q3UUV5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Skap1Q3UUV5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Skap1Q3UUV5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Skap1Q3UUV5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Skap1Q3UUV5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Skap1Q3UUV5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Skap1Q3UUV5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Skap1Q3UUV5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Skap1Q3UUV5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Skap1Q3UUV5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Skap1Q3UUV5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Skap1Q3UUV5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Skap1Q3UUV5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Skap1Q3UUV5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Skap1Q3UUV5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Skap1Q3UUV5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Skap1Q3UUV5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Skap1Q3UUV5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Skap1Q3UUV5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Skap1Q3UUV5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Skap1Q3UUV5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Skap1Q3UUV5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Skap1Q3UUV5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Skap1Q3UUV5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Skap1Q3UUV5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Skap1Q3UUV5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Skap1Q3UUV5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Skap1Q3UUV5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Skap1Q3UUV5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Skap1Q3UUV5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Skap1Q3UUV5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Skap1Q3UUV5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Skap1Q3UUV5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Skap1Q3UUV5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Skap1Q3UUV5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.3 ms