Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTE2

Gm428, Predicted gene 428, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm428Q3UTE2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm428Q3UTE2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm428Q3UTE2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm428Q3UTE2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm428Q3UTE2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm428Q3UTE2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm428Q3UTE2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm428Q3UTE2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm428Q3UTE2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm428Q3UTE2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm428Q3UTE2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm428Q3UTE2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm428Q3UTE2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm428Q3UTE2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm428Q3UTE2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm428Q3UTE2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm428Q3UTE2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm428Q3UTE2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm428Q3UTE2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm428Q3UTE2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm428Q3UTE2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm428Q3UTE2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm428Q3UTE2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm428Q3UTE2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm428Q3UTE2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm428Q3UTE2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm428Q3UTE2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm428Q3UTE2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm428Q3UTE2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm428Q3UTE2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm428Q3UTE2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm428Q3UTE2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm428Q3UTE2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm428Q3UTE2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm428Q3UTE2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm428Q3UTE2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm428Q3UTE2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm428Q3UTE2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm428Q3UTE2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm428Q3UTE2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm428Q3UTE2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm428Q3UTE2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm428Q3UTE2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm428Q3UTE2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm428Q3UTE2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm428Q3UTE2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm428Q3UTE2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm428Q3UTE2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm428Q3UTE2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm428Q3UTE2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm428Q3UTE2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm428Q3UTE2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm428Q3UTE2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm428Q3UTE2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm428Q3UTE2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm428Q3UTE2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm428Q3UTE2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm428Q3UTE2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm428Q3UTE2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm428Q3UTE2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm428Q3UTE2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm428Q3UTE2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm428Q3UTE2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm428Q3UTE2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm428Q3UTE2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm428Q3UTE2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm428Q3UTE2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm428Q3UTE2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm428Q3UTE2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm428Q3UTE2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm428Q3UTE2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm428Q3UTE2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm428Q3UTE2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm428Q3UTE2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm428Q3UTE2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm428Q3UTE2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm428Q3UTE2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm428Q3UTE2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm428Q3UTE2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm428Q3UTE2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm428Q3UTE2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm428Q3UTE2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm428Q3UTE2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm428Q3UTE2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm428Q3UTE2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm428Q3UTE2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm428Q3UTE2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm428Q3UTE2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm428Q3UTE2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm428Q3UTE2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm428Q3UTE2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm428Q3UTE2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm428Q3UTE2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms