Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkain3Q3URJ8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms