Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrc4Q3UP24 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrc4Q3UP24 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrc4Q3UP24 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrc4Q3UP24 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrc4Q3UP24 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrc4Q3UP24 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrc4Q3UP24 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrc4Q3UP24 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrc4Q3UP24 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrc4Q3UP24 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrc4Q3UP24 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrc4Q3UP24 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrc4Q3UP24 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrc4Q3UP24 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrc4Q3UP24 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrc4Q3UP24 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrc4Q3UP24 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrc4Q3UP24 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrc4Q3UP24 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrc4Q3UP24 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrc4Q3UP24 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrc4Q3UP24 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrc4Q3UP24 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrc4Q3UP24 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrc4Q3UP24 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrc4Q3UP24 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrc4Q3UP24 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrc4Q3UP24 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrc4Q3UP24 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrc4Q3UP24 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrc4Q3UP24 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrc4Q3UP24 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrc4Q3UP24 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrc4Q3UP24 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrc4Q3UP24 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrc4Q3UP24 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrc4Q3UP24 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrc4Q3UP24 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrc4Q3UP24 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrc4Q3UP24 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrc4Q3UP24 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrc4Q3UP24 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrc4Q3UP24 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrc4Q3UP24 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrc4Q3UP24 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrc4Q3UP24 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrc4Q3UP24 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrc4Q3UP24 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrc4Q3UP24 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrc4Q3UP24 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrc4Q3UP24 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrc4Q3UP24 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrc4Q3UP24 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrc4Q3UP24 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrc4Q3UP24 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 190.9 ms