Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB5

Smcr8, Guanine nucleotide exchange protein SMCR8, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smcr8Q3UMB5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Smcr8Q3UMB5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smcr8Q3UMB5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Smcr8Q3UMB5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smcr8Q3UMB5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smcr8Q3UMB5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smcr8Q3UMB5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smcr8Q3UMB5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smcr8Q3UMB5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smcr8Q3UMB5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smcr8Q3UMB5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smcr8Q3UMB5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smcr8Q3UMB5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smcr8Q3UMB5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Smcr8Q3UMB5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smcr8Q3UMB5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smcr8Q3UMB5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Smcr8Q3UMB5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smcr8Q3UMB5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smcr8Q3UMB5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smcr8Q3UMB5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smcr8Q3UMB5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smcr8Q3UMB5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smcr8Q3UMB5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smcr8Q3UMB5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smcr8Q3UMB5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smcr8Q3UMB5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smcr8Q3UMB5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smcr8Q3UMB5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smcr8Q3UMB5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smcr8Q3UMB5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smcr8Q3UMB5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smcr8Q3UMB5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smcr8Q3UMB5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smcr8Q3UMB5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smcr8Q3UMB5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smcr8Q3UMB5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smcr8Q3UMB5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smcr8Q3UMB5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smcr8Q3UMB5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smcr8Q3UMB5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smcr8Q3UMB5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smcr8Q3UMB5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smcr8Q3UMB5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smcr8Q3UMB5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smcr8Q3UMB5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smcr8Q3UMB5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smcr8Q3UMB5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smcr8Q3UMB5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smcr8Q3UMB5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smcr8Q3UMB5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smcr8Q3UMB5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smcr8Q3UMB5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smcr8Q3UMB5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smcr8Q3UMB5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smcr8Q3UMB5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms