Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rmdn3Q3UJU9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rmdn3Q3UJU9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rmdn3Q3UJU9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rmdn3Q3UJU9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rmdn3Q3UJU9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rmdn3Q3UJU9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rmdn3Q3UJU9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rmdn3Q3UJU9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rmdn3Q3UJU9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rmdn3Q3UJU9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rmdn3Q3UJU9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rmdn3Q3UJU9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rmdn3Q3UJU9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rmdn3Q3UJU9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rmdn3Q3UJU9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rmdn3Q3UJU9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rmdn3Q3UJU9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rmdn3Q3UJU9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rmdn3Q3UJU9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rmdn3Q3UJU9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rmdn3Q3UJU9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rmdn3Q3UJU9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rmdn3Q3UJU9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rmdn3Q3UJU9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms