Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGK8

Gm5113, Predicted gene 5113, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5113Q3UGK8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5113Q3UGK8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5113Q3UGK8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5113Q3UGK8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5113Q3UGK8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5113Q3UGK8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5113Q3UGK8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5113Q3UGK8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5113Q3UGK8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5113Q3UGK8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5113Q3UGK8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5113Q3UGK8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5113Q3UGK8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5113Q3UGK8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5113Q3UGK8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5113Q3UGK8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5113Q3UGK8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5113Q3UGK8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5113Q3UGK8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5113Q3UGK8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5113Q3UGK8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5113Q3UGK8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5113Q3UGK8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5113Q3UGK8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5113Q3UGK8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5113Q3UGK8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5113Q3UGK8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5113Q3UGK8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5113Q3UGK8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5113Q3UGK8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5113Q3UGK8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5113Q3UGK8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5113Q3UGK8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5113Q3UGK8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5113Q3UGK8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5113Q3UGK8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5113Q3UGK8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5113Q3UGK8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5113Q3UGK8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms