Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trappc10Q3TLI0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trappc10Q3TLI0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trappc10Q3TLI0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Trappc10Q3TLI0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trappc10Q3TLI0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trappc10Q3TLI0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc10Q3TLI0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc10Q3TLI0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc10Q3TLI0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc10Q3TLI0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc10Q3TLI0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc10Q3TLI0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc10Q3TLI0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc10Q3TLI0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc10Q3TLI0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc10Q3TLI0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc10Q3TLI0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trappc10Q3TLI0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trappc10Q3TLI0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trappc10Q3TLI0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trappc10Q3TLI0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trappc10Q3TLI0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trappc10Q3TLI0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc10Q3TLI0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc10Q3TLI0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc10Q3TLI0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc10Q3TLI0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc10Q3TLI0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc10Q3TLI0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc10Q3TLI0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc10Q3TLI0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc10Q3TLI0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc10Q3TLI0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc10Q3TLI0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc10Q3TLI0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc10Q3TLI0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trappc10Q3TLI0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trappc10Q3TLI0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trappc10Q3TLI0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc10Q3TLI0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc10Q3TLI0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc10Q3TLI0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc10Q3TLI0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc10Q3TLI0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc10Q3TLI0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trappc10Q3TLI0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms