Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlrx1Q3TL44 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlrx1Q3TL44 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlrx1Q3TL44 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlrx1Q3TL44 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlrx1Q3TL44 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrx1Q3TL44 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrx1Q3TL44 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrx1Q3TL44 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrx1Q3TL44 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrx1Q3TL44 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrx1Q3TL44 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrx1Q3TL44 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrx1Q3TL44 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrx1Q3TL44 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrx1Q3TL44 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrx1Q3TL44 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrx1Q3TL44 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlrx1Q3TL44 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlrx1Q3TL44 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlrx1Q3TL44 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlrx1Q3TL44 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlrx1Q3TL44 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlrx1Q3TL44 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlrx1Q3TL44 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrx1Q3TL44 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrx1Q3TL44 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrx1Q3TL44 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrx1Q3TL44 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrx1Q3TL44 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrx1Q3TL44 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nlrx1Q3TL44 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nlrx1Q3TL44 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nlrx1Q3TL44 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nlrx1Q3TL44 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nlrx1Q3TL44 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nlrx1Q3TL44 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlrx1Q3TL44 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlrx1Q3TL44 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlrx1Q3TL44 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlrx1Q3TL44 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlrx1Q3TL44 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlrx1Q3TL44 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlrx1Q3TL44 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlrx1Q3TL44 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlrx1Q3TL44 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrx1Q3TL44 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrx1Q3TL44 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrx1Q3TL44 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrx1Q3TL44 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrx1Q3TL44 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrx1Q3TL44 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrx1Q3TL44 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrx1Q3TL44 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrx1Q3TL44 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nlrx1Q3TL44 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nlrx1Q3TL44 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Nlrx1Q3TL44 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Nlrx1Q3TL44 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nlrx1Q3TL44 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlrx1Q3TL44 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlrx1Q3TL44 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlrx1Q3TL44 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlrx1Q3TL44 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlrx1Q3TL44 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlrx1Q3TL44 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlrx1Q3TL44 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nlrx1Q3TL44 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nlrx1Q3TL44 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nlrx1Q3TL44 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nlrx1Q3TL44 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nlrx1Q3TL44 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms