Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdlim7Q3TJD7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdlim7Q3TJD7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdlim7Q3TJD7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdlim7Q3TJD7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdlim7Q3TJD7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdlim7Q3TJD7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdlim7Q3TJD7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdlim7Q3TJD7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdlim7Q3TJD7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdlim7Q3TJD7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdlim7Q3TJD7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdlim7Q3TJD7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdlim7Q3TJD7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdlim7Q3TJD7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdlim7Q3TJD7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdlim7Q3TJD7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 292 ms