Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf2f1Q3THK3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf2f1Q3THK3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf2f1Q3THK3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf2f1Q3THK3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf2f1Q3THK3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf2f1Q3THK3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf2f1Q3THK3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf2f1Q3THK3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf2f1Q3THK3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf2f1Q3THK3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf2f1Q3THK3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf2f1Q3THK3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf2f1Q3THK3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf2f1Q3THK3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf2f1Q3THK3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf2f1Q3THK3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf2f1Q3THK3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf2f1Q3THK3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf2f1Q3THK3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf2f1Q3THK3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf2f1Q3THK3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf2f1Q3THK3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf2f1Q3THK3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf2f1Q3THK3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf2f1Q3THK3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf2f1Q3THK3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf2f1Q3THK3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf2f1Q3THK3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf2f1Q3THK3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf2f1Q3THK3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf2f1Q3THK3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf2f1Q3THK3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf2f1Q3THK3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf2f1Q3THK3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf2f1Q3THK3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf2f1Q3THK3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gtf2f1Q3THK3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gtf2f1Q3THK3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gtf2f1Q3THK3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf2f1Q3THK3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms