Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zfp444Q3TDV8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zfp444Q3TDV8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zfp444Q3TDV8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zfp444Q3TDV8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zfp444Q3TDV8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zfp444Q3TDV8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zfp444Q3TDV8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zfp444Q3TDV8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zfp444Q3TDV8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zfp444Q3TDV8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zfp444Q3TDV8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Zfp444Q3TDV8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Zfp444Q3TDV8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Zfp444Q3TDV8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Zfp444Q3TDV8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Zfp444Q3TDV8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Zfp444Q3TDV8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zfp444Q3TDV8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zfp444Q3TDV8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zfp444Q3TDV8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zfp444Q3TDV8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zfp444Q3TDV8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Zfp444Q3TDV8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zfp444Q3TDV8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Zfp444Q3TDV8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Zfp444Q3TDV8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Zfp444Q3TDV8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Zfp444Q3TDV8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zfp444Q3TDV8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zfp444Q3TDV8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zfp444Q3TDV8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zfp444Q3TDV8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zfp444Q3TDV8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zfp444Q3TDV8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zfp444Q3TDV8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Zfp444Q3TDV8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zfp444Q3TDV8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zfp444Q3TDV8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zfp444Q3TDV8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zfp444Q3TDV8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zfp444Q3TDV8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zfp444Q3TDV8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zfp444Q3TDV8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zfp444Q3TDV8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zfp444Q3TDV8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Zfp444Q3TDV8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zfp444Q3TDV8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zfp444Q3TDV8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zfp444Q3TDV8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zfp444Q3TDV8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zfp444Q3TDV8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zfp444Q3TDV8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zfp444Q3TDV8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zfp444Q3TDV8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Zfp444Q3TDV8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Zfp444Q3TDV8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Zfp444Q3TDV8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Zfp444Q3TDV8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Zfp444Q3TDV8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Zfp444Q3TDV8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Zfp444Q3TDV8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Zfp444Q3TDV8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Zfp444Q3TDV8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Zfp444Q3TDV8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zfp444Q3TDV8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zfp444Q3TDV8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zfp444Q3TDV8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zfp444Q3TDV8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Zfp444Q3TDV8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zfp444Q3TDV8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zfp444Q3TDV8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zfp444Q3TDV8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zfp444Q3TDV8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zfp444Q3TDV8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zfp444Q3TDV8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zfp444Q3TDV8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zfp444Q3TDV8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zfp444Q3TDV8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zfp444Q3TDV8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Zfp444Q3TDV8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Zfp444Q3TDV8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Zfp444Q3TDV8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Zfp444Q3TDV8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Zfp444Q3TDV8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zfp444Q3TDV8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zfp444Q3TDV8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zfp444Q3TDV8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zfp444Q3TDV8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zfp444Q3TDV8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zfp444Q3TDV8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zfp444Q3TDV8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zfp444Q3TDV8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zfp444Q3TDV8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zfp444Q3TDV8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Zfp444Q3TDV8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Zfp444Q3TDV8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Zfp444Q3TDV8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Zfp444Q3TDV8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Zfp444Q3TDV8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms