Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VrtnQ3SYK4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VrtnQ3SYK4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VrtnQ3SYK4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VrtnQ3SYK4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VrtnQ3SYK4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VrtnQ3SYK4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VrtnQ3SYK4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VrtnQ3SYK4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VrtnQ3SYK4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VrtnQ3SYK4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VrtnQ3SYK4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VrtnQ3SYK4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VrtnQ3SYK4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VrtnQ3SYK4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VrtnQ3SYK4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VrtnQ3SYK4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VrtnQ3SYK4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
VrtnQ3SYK4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
VrtnQ3SYK4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VrtnQ3SYK4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VrtnQ3SYK4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VrtnQ3SYK4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VrtnQ3SYK4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VrtnQ3SYK4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VrtnQ3SYK4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VrtnQ3SYK4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VrtnQ3SYK4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VrtnQ3SYK4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VrtnQ3SYK4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VrtnQ3SYK4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
VrtnQ3SYK4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VrtnQ3SYK4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VrtnQ3SYK4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VrtnQ3SYK4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VrtnQ3SYK4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VrtnQ3SYK4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VrtnQ3SYK4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VrtnQ3SYK4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VrtnQ3SYK4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VrtnQ3SYK4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
VrtnQ3SYK4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VrtnQ3SYK4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VrtnQ3SYK4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VrtnQ3SYK4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VrtnQ3SYK4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VrtnQ3SYK4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VrtnQ3SYK4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
VrtnQ3SYK4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VrtnQ3SYK4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VrtnQ3SYK4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VrtnQ3SYK4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VrtnQ3SYK4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VrtnQ3SYK4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VrtnQ3SYK4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VrtnQ3SYK4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VrtnQ3SYK4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VrtnQ3SYK4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VrtnQ3SYK4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VrtnQ3SYK4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VrtnQ3SYK4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VrtnQ3SYK4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VrtnQ3SYK4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VrtnQ3SYK4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VrtnQ3SYK4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VrtnQ3SYK4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VrtnQ3SYK4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VrtnQ3SYK4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VrtnQ3SYK4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VrtnQ3SYK4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VrtnQ3SYK4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VrtnQ3SYK4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VrtnQ3SYK4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VrtnQ3SYK4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VrtnQ3SYK4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VrtnQ3SYK4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VrtnQ3SYK4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VrtnQ3SYK4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VrtnQ3SYK4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VrtnQ3SYK4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VrtnQ3SYK4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VrtnQ3SYK4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VrtnQ3SYK4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VrtnQ3SYK4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VrtnQ3SYK4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VrtnQ3SYK4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VrtnQ3SYK4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VrtnQ3SYK4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VrtnQ3SYK4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VrtnQ3SYK4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VrtnQ3SYK4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VrtnQ3SYK4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VrtnQ3SYK4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VrtnQ3SYK4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VrtnQ3SYK4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VrtnQ3SYK4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VrtnQ3SYK4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VrtnQ3SYK4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VrtnQ3SYK4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms