Protein–RNA interactions for Protein: Q2KN98

Specc1l, Cytospin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1lQ2KN98 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Specc1lQ2KN98 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Specc1lQ2KN98 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Specc1lQ2KN98 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Specc1lQ2KN98 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Specc1lQ2KN98 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Specc1lQ2KN98 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Specc1lQ2KN98 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Specc1lQ2KN98 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Specc1lQ2KN98 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Specc1lQ2KN98 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Specc1lQ2KN98 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Specc1lQ2KN98 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Specc1lQ2KN98 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Specc1lQ2KN98 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Specc1lQ2KN98 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Specc1lQ2KN98 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Specc1lQ2KN98 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Specc1lQ2KN98 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Specc1lQ2KN98 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Specc1lQ2KN98 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Specc1lQ2KN98 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Specc1lQ2KN98 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Specc1lQ2KN98 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Specc1lQ2KN98 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Specc1lQ2KN98 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Specc1lQ2KN98 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Specc1lQ2KN98 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Specc1lQ2KN98 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Specc1lQ2KN98 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Specc1lQ2KN98 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Specc1lQ2KN98 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Specc1lQ2KN98 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Specc1lQ2KN98 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Specc1lQ2KN98 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Specc1lQ2KN98 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Specc1lQ2KN98 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Specc1lQ2KN98 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Specc1lQ2KN98 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Specc1lQ2KN98 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Specc1lQ2KN98 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Specc1lQ2KN98 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Specc1lQ2KN98 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Specc1lQ2KN98 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Specc1lQ2KN98 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Specc1lQ2KN98 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Specc1lQ2KN98 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Specc1lQ2KN98 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Specc1lQ2KN98 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Specc1lQ2KN98 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Specc1lQ2KN98 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Specc1lQ2KN98 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Specc1lQ2KN98 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Specc1lQ2KN98 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Specc1lQ2KN98 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Specc1lQ2KN98 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Specc1lQ2KN98 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Specc1lQ2KN98 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Specc1lQ2KN98 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Specc1lQ2KN98 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Specc1lQ2KN98 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Specc1lQ2KN98 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Specc1lQ2KN98 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Specc1lQ2KN98 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Specc1lQ2KN98 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Specc1lQ2KN98 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Specc1lQ2KN98 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms