Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU8

Bpifa6, BPI fold-containing family A, member 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bpifa6Q0VGU8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bpifa6Q0VGU8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bpifa6Q0VGU8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bpifa6Q0VGU8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bpifa6Q0VGU8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bpifa6Q0VGU8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bpifa6Q0VGU8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bpifa6Q0VGU8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bpifa6Q0VGU8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bpifa6Q0VGU8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bpifa6Q0VGU8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bpifa6Q0VGU8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bpifa6Q0VGU8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bpifa6Q0VGU8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bpifa6Q0VGU8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bpifa6Q0VGU8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bpifa6Q0VGU8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bpifa6Q0VGU8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bpifa6Q0VGU8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Bpifa6Q0VGU8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bpifa6Q0VGU8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bpifa6Q0VGU8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bpifa6Q0VGU8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bpifa6Q0VGU8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bpifa6Q0VGU8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bpifa6Q0VGU8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Bpifa6Q0VGU8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bpifa6Q0VGU8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bpifa6Q0VGU8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bpifa6Q0VGU8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Bpifa6Q0VGU8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Bpifa6Q0VGU8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bpifa6Q0VGU8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bpifa6Q0VGU8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bpifa6Q0VGU8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bpifa6Q0VGU8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bpifa6Q0VGU8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bpifa6Q0VGU8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bpifa6Q0VGU8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bpifa6Q0VGU8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bpifa6Q0VGU8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bpifa6Q0VGU8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bpifa6Q0VGU8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Bpifa6Q0VGU8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bpifa6Q0VGU8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bpifa6Q0VGU8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bpifa6Q0VGU8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bpifa6Q0VGU8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms