Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPINDOCQ05AH6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPINDOCQ05AH6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPINDOCQ05AH6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPINDOCQ05AH6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPINDOCQ05AH6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPINDOCQ05AH6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPINDOCQ05AH6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPINDOCQ05AH6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPINDOCQ05AH6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPINDOCQ05AH6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPINDOCQ05AH6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPINDOCQ05AH6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPINDOCQ05AH6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPINDOCQ05AH6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPINDOCQ05AH6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPINDOCQ05AH6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPINDOCQ05AH6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPINDOCQ05AH6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPINDOCQ05AH6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPINDOCQ05AH6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPINDOCQ05AH6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPINDOCQ05AH6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPINDOCQ05AH6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPINDOCQ05AH6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SPINDOCQ05AH6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPINDOCQ05AH6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPINDOCQ05AH6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SPINDOCQ05AH6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPINDOCQ05AH6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPINDOCQ05AH6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPINDOCQ05AH6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPINDOCQ05AH6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPINDOCQ05AH6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPINDOCQ05AH6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPINDOCQ05AH6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPINDOCQ05AH6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPINDOCQ05AH6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPINDOCQ05AH6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPINDOCQ05AH6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPINDOCQ05AH6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPINDOCQ05AH6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPINDOCQ05AH6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPINDOCQ05AH6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPINDOCQ05AH6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPINDOCQ05AH6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SPINDOCQ05AH6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SPINDOCQ05AH6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPINDOCQ05AH6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPINDOCQ05AH6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPINDOCQ05AH6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPINDOCQ05AH6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPINDOCQ05AH6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPINDOCQ05AH6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPINDOCQ05AH6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPINDOCQ05AH6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPINDOCQ05AH6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPINDOCQ05AH6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPINDOCQ05AH6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPINDOCQ05AH6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPINDOCQ05AH6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPINDOCQ05AH6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPINDOCQ05AH6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPINDOCQ05AH6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SPINDOCQ05AH6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms