Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
PtprgQ05909 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PtprgQ05909 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PtprgQ05909 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PtprgQ05909 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PtprgQ05909 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PtprgQ05909 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PtprgQ05909 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PtprgQ05909 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
PtprgQ05909 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PtprgQ05909 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PtprgQ05909 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PtprgQ05909 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PtprgQ05909 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PtprgQ05909 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PtprgQ05909 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PtprgQ05909 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PtprgQ05909 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PtprgQ05909 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PtprgQ05909 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PtprgQ05909 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PtprgQ05909 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PtprgQ05909 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PtprgQ05909 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PtprgQ05909 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PtprgQ05909 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PtprgQ05909 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PtprgQ05909 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PtprgQ05909 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PtprgQ05909 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PtprgQ05909 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PtprgQ05909 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PtprgQ05909 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PtprgQ05909 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
PtprgQ05909 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PtprgQ05909 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PtprgQ05909 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PtprgQ05909 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PtprgQ05909 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PtprgQ05909 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PtprgQ05909 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PtprgQ05909 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PtprgQ05909 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PtprgQ05909 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PtprgQ05909 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PtprgQ05909 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PtprgQ05909 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PtprgQ05909 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
PtprgQ05909 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
PtprgQ05909 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PtprgQ05909 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PtprgQ05909 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PtprgQ05909 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PtprgQ05909 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PtprgQ05909 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PtprgQ05909 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PtprgQ05909 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PtprgQ05909 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PtprgQ05909 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
PtprgQ05909 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PtprgQ05909 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PtprgQ05909 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PtprgQ05909 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PtprgQ05909 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PtprgQ05909 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PtprgQ05909 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PtprgQ05909 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PtprgQ05909 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PtprgQ05909 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PtprgQ05909 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PtprgQ05909 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PtprgQ05909 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PtprgQ05909 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PtprgQ05909 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PtprgQ05909 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PtprgQ05909 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PtprgQ05909 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PtprgQ05909 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PtprgQ05909 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PtprgQ05909 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PtprgQ05909 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PtprgQ05909 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PtprgQ05909 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PtprgQ05909 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PtprgQ05909 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PtprgQ05909 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
PtprgQ05909 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PtprgQ05909 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PtprgQ05909 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PtprgQ05909 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PtprgQ05909 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PtprgQ05909 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PtprgQ05909 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PtprgQ05909 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PtprgQ05909 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PtprgQ05909 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PtprgQ05909 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PtprgQ05909 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PtprgQ05909 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PtprgQ05909 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms