Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pfdn6Q03958 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pfdn6Q03958 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms