Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scg2Q03517 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scg2Q03517 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scg2Q03517 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scg2Q03517 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scg2Q03517 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scg2Q03517 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scg2Q03517 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scg2Q03517 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scg2Q03517 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scg2Q03517 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scg2Q03517 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scg2Q03517 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scg2Q03517 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scg2Q03517 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scg2Q03517 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scg2Q03517 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scg2Q03517 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scg2Q03517 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scg2Q03517 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scg2Q03517 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scg2Q03517 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scg2Q03517 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scg2Q03517 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scg2Q03517 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scg2Q03517 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scg2Q03517 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scg2Q03517 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scg2Q03517 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scg2Q03517 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scg2Q03517 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scg2Q03517 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scg2Q03517 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scg2Q03517 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Scg2Q03517 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scg2Q03517 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scg2Q03517 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scg2Q03517 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scg2Q03517 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scg2Q03517 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Scg2Q03517 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scg2Q03517 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scg2Q03517 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Scg2Q03517 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scg2Q03517 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scg2Q03517 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scg2Q03517 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scg2Q03517 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scg2Q03517 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Scg2Q03517 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scg2Q03517 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scg2Q03517 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scg2Q03517 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scg2Q03517 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scg2Q03517 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scg2Q03517 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scg2Q03517 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scg2Q03517 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scg2Q03517 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scg2Q03517 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Scg2Q03517 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scg2Q03517 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scg2Q03517 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scg2Q03517 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scg2Q03517 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scg2Q03517 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scg2Q03517 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scg2Q03517 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scg2Q03517 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scg2Q03517 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scg2Q03517 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scg2Q03517 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scg2Q03517 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scg2Q03517 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scg2Q03517 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scg2Q03517 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scg2Q03517 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scg2Q03517 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scg2Q03517 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scg2Q03517 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scg2Q03517 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scg2Q03517 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scg2Q03517 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scg2Q03517 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scg2Q03517 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scg2Q03517 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scg2Q03517 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scg2Q03517 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scg2Q03517 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scg2Q03517 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scg2Q03517 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scg2Q03517 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scg2Q03517 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scg2Q03517 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scg2Q03517 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scg2Q03517 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scg2Q03517 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scg2Q03517 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms