Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ascl1Q02067 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms