Protein–RNA interactions for Protein: Q00899

Yy1, Transcriptional repressor protein YY1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yy1Q00899 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Yy1Q00899 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Yy1Q00899 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Yy1Q00899 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Yy1Q00899 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Yy1Q00899 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Yy1Q00899 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Yy1Q00899 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Yy1Q00899 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Yy1Q00899 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Yy1Q00899 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Yy1Q00899 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Yy1Q00899 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Yy1Q00899 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Yy1Q00899 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Yy1Q00899 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Yy1Q00899 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Yy1Q00899 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Yy1Q00899 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Yy1Q00899 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Yy1Q00899 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Yy1Q00899 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Yy1Q00899 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Yy1Q00899 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Yy1Q00899 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Yy1Q00899 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Yy1Q00899 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Yy1Q00899 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Yy1Q00899 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Yy1Q00899 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Yy1Q00899 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Yy1Q00899 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Yy1Q00899 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Yy1Q00899 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Yy1Q00899 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Yy1Q00899 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Yy1Q00899 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Yy1Q00899 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Yy1Q00899 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Yy1Q00899 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Yy1Q00899 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Yy1Q00899 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Yy1Q00899 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Yy1Q00899 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Yy1Q00899 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Yy1Q00899 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Yy1Q00899 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Yy1Q00899 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Yy1Q00899 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Yy1Q00899 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Yy1Q00899 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Yy1Q00899 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Yy1Q00899 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Yy1Q00899 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Yy1Q00899 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Yy1Q00899 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Yy1Q00899 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.1 ms