Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cmklr1P97468 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms