Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Otx1P80205 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Otx1P80205 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Otx1P80205 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otx1P80205 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otx1P80205 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otx1P80205 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otx1P80205 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otx1P80205 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Otx1P80205 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otx1P80205 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otx1P80205 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Otx1P80205 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Otx1P80205 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otx1P80205 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otx1P80205 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otx1P80205 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otx1P80205 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otx1P80205 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otx1P80205 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otx1P80205 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otx1P80205 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otx1P80205 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otx1P80205 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otx1P80205 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otx1P80205 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otx1P80205 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otx1P80205 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otx1P80205 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otx1P80205 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otx1P80205 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otx1P80205 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otx1P80205 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otx1P80205 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Otx1P80205 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otx1P80205 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otx1P80205 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otx1P80205 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otx1P80205 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otx1P80205 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otx1P80205 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otx1P80205 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otx1P80205 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otx1P80205 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otx1P80205 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otx1P80205 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otx1P80205 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otx1P80205 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otx1P80205 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otx1P80205 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otx1P80205 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Otx1P80205 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otx1P80205 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otx1P80205 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otx1P80205 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms