Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CiitaP79621 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CiitaP79621 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CiitaP79621 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CiitaP79621 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CiitaP79621 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CiitaP79621 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CiitaP79621 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CiitaP79621 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CiitaP79621 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CiitaP79621 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CiitaP79621 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CiitaP79621 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CiitaP79621 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CiitaP79621 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CiitaP79621 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CiitaP79621 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CiitaP79621 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CiitaP79621 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CiitaP79621 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CiitaP79621 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CiitaP79621 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CiitaP79621 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CiitaP79621 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CiitaP79621 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CiitaP79621 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CiitaP79621 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CiitaP79621 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CiitaP79621 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CiitaP79621 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CiitaP79621 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CiitaP79621 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CiitaP79621 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CiitaP79621 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CiitaP79621 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CiitaP79621 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CiitaP79621 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CiitaP79621 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CiitaP79621 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CiitaP79621 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CiitaP79621 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CiitaP79621 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CiitaP79621 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CiitaP79621 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CiitaP79621 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CiitaP79621 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CiitaP79621 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CiitaP79621 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CiitaP79621 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CiitaP79621 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CiitaP79621 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CiitaP79621 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CiitaP79621 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CiitaP79621 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.4 ms