Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtnP63089 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtnP63089 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtnP63089 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtnP63089 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtnP63089 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtnP63089 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtnP63089 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtnP63089 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtnP63089 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtnP63089 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtnP63089 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtnP63089 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtnP63089 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtnP63089 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PtnP63089 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtnP63089 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtnP63089 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtnP63089 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtnP63089 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtnP63089 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtnP63089 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtnP63089 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtnP63089 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtnP63089 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtnP63089 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtnP63089 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtnP63089 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtnP63089 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtnP63089 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtnP63089 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtnP63089 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtnP63089 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PtnP63089 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtnP63089 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtnP63089 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtnP63089 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtnP63089 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtnP63089 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtnP63089 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtnP63089 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtnP63089 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtnP63089 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtnP63089 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtnP63089 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtnP63089 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtnP63089 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtnP63089 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtnP63089 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtnP63089 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtnP63089 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtnP63089 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtnP63089 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtnP63089 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtnP63089 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtnP63089 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PtnP63089 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtnP63089 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtnP63089 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtnP63089 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtnP63089 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtnP63089 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtnP63089 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtnP63089 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtnP63089 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtnP63089 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtnP63089 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtnP63089 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtnP63089 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtnP63089 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtnP63089 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtnP63089 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtnP63089 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtnP63089 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtnP63089 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtnP63089 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtnP63089 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtnP63089 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtnP63089 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtnP63089 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtnP63089 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtnP63089 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PtnP63089 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtnP63089 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtnP63089 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtnP63089 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtnP63089 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtnP63089 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtnP63089 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtnP63089 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtnP63089 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtnP63089 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtnP63089 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtnP63089 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtnP63089 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtnP63089 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtnP63089 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtnP63089 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PtnP63089 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtnP63089 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 195.3 ms