Protein–RNA interactions for Protein: P63011

Rab3a, Ras-related protein Rab-3A, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3aP63011 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab3aP63011 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab3aP63011 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab3aP63011 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab3aP63011 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab3aP63011 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab3aP63011 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab3aP63011 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab3aP63011 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab3aP63011 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab3aP63011 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab3aP63011 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab3aP63011 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab3aP63011 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab3aP63011 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab3aP63011 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab3aP63011 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab3aP63011 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab3aP63011 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab3aP63011 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab3aP63011 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3aP63011 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rab3aP63011 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rab3aP63011 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3aP63011 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3aP63011 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3aP63011 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3aP63011 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3aP63011 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3aP63011 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3aP63011 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3aP63011 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3aP63011 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3aP63011 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3aP63011 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab3aP63011 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab3aP63011 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab3aP63011 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab3aP63011 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab3aP63011 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab3aP63011 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab3aP63011 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab3aP63011 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab3aP63011 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.7 ms