Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab1AP62821 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab1AP62821 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab1AP62821 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab1AP62821 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab1AP62821 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab1AP62821 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab1AP62821 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab1AP62821 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab1AP62821 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab1AP62821 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab1AP62821 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab1AP62821 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab1AP62821 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab1AP62821 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab1AP62821 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab1AP62821 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab1AP62821 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab1AP62821 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab1AP62821 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab1AP62821 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab1AP62821 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab1AP62821 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab1AP62821 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab1AP62821 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab1AP62821 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab1AP62821 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab1AP62821 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab1AP62821 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab1AP62821 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab1AP62821 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab1AP62821 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab1AP62821 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab1AP62821 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab1AP62821 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab1AP62821 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab1AP62821 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab1AP62821 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab1AP62821 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab1AP62821 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab1AP62821 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms